桐人、尤吉欧、爱丽丝。两名修剑士与一名整合骑士,将最高司祭·亚多米尼史特蕾达击破后过了半年。战斗结束,回到故乡卢利特村生活的爱丽丝。她的身旁,是失去亲友、也失去自己的手臂与心的桐人。奉献自己支持着他的爱丽丝,无法再像从前一样保有身为骑士的心。「告诉我,桐人……我该怎么办……」但,将Underworld全境引向悲剧的《最终负荷实验》的倒计时,毫不留情地推进着。如同对此呼应一般,在《黑暗领域》的深处,暗黑神贝库达复活了。他率领黑暗军势,为了获得《光之巫女》而开始向《人界》发起进攻。指挥《人界》军的整合骑士贝尔